Suruhanjaya Persediaan mengumumkan pada 27 Oktober 2022 bahawa Kongres ke-16 akan berlangsung antara 13 dan 17 Januari 2023 di wilaya Dajla, di kem pelarian Sahrawi Tindouf. Ia juga menggunakan simbol bagi Kongres.[3] Disebabkan situasi perang, yang bermula apabila gencatan senjata dengan Maghribi gagal pada November 2020 selepas Maghribi menghantar tentera ke bahagian selatan Sahara Barat untuk menyuraikan penunjuk perasaan Sahrawi yang menghalang satu-satunya lebuh raya ke Mauritania, Kongres tidak diadakan di Zon Bebas.[5][6]

"Persidangan Persediaan Kebangsaan" telah diadakan beberapa hari sebelum Kongres, antara 8 dan 11 Januari, untuk menyelesaikan pertikaian dan mencari kedudukan bersatu di dalam Barisan, terutamanya terhadap pencalonan Setiausaha Agung.[7][8]

Kongres telah dilanjutkan dua kali kerana panjangnya perbahasan: ia pertama kali mendapat lanjutan 48 jam sehingga 19 Januari 2023 dan kemudian mendapat 72 jam sehingga 22 Januari 2023.[9][10]

Semasa Kongres, ahli mengundi untuk meminda Undang-Undang Asas Barisan Polisario untuk menukar peraturan mengenai Sekretariat Kebangsaan, memaksa pembaharuan sekurang-kurangnya enam ahli baharu dalam setiap penggal, selain mengurangkan ahli daripada 50 kepada 44 dengan memecat dua daripada 29 ahli yang dipilih oleh Kongres dan tidak termasuk organisasi massa (Kesatuan Kebangsaan Wanita Sahrawi, Kesatuan Sekerja Sahrawi, Kesatuan Belia Sahrawi dan Kesatuan Pelajar Sahrawi) daripada mempunyai perwakilan langsung dalam Sekretariat Kebangsaan.[11]